Secţia de neonatologie este amenajată pe etajul 4. al corpului de clădire A (aripa de nord al clădirii principale). Serviciile sale sunt complementare cu secţia de ginecologie-obstetrică.

- secţia dispune de aparatură de înaltă performanţă

-  secţia beneficiează de finanţare din partea spitalului din sumele contractate cu  Casa de Asigurări de Sănătate al Judeţului Harghita, în funcţie de indicatorii asumaţi şi realizaţi în contractul de administrare semnat cu managerul spitalului.